Su padre era comerciante local y más tarde importador de Royal Tobacco para Schweidnitz y Jauer. Su madre era hija de un cirujano muy respetado. Recibió su primera educación musical en la escuela latina de la Santísima Trinidad en su ciudad natal. Su especial inclinación por la música le llevó a realizar un breve período de estudios en Breslau con los músicos de la corte que estaban bajo el empleo del arzobispo de la ciudad. En 1729 su padre lo envió a Frankfurt an der Oder, donde estudió derecho en la Universidad hasta 1733. Durante este tiempo recibió sus primeros encargos para escribir obras musicales de gran formato para ocasiones festivas.

Edición discográfica de obras de Johann Gottlieb Janitsch

En 1733, Janitsch se mudó a Berlín durante tres años como secretario de estado prusiano del ministro de guerra, Franz Wilhelm von Happe. En 1736, el entonces Príncipe Heredero, Federico le ofreció un puesto como "Contraviolinista" en su conjunto en Ruppin y un año más tarde, en Rheinsberg , donde la casa de Janitsch fue destruida en el gran incendio de 1740. Durante su tiempo en Rheinsberg, con el permiso del príncipe heredero, fundó el círculo "Freitagsakademien" (academias de los viernes), en el que la música era interpretada por músicos profesionales y aficionados por igual.

A partir de 1740, cuando Federico ascendió al trono de Prusia, el puesto de Janitsch como contraviolinista se transfirió a la recién fundada Orquesta de la Corte de Berlín, donde recibió un salario de 350 táleros. Las academias de los viernes continuaron en Berlín en su casa en forma de conciertos semanales abiertos al público. Esta asociación musical fue la primera de una larga lista de organizaciones similares que surgieron en Berlín después de 1750. A partir de 1743, se le pidió a Janitsch que compusiera y organizara "Redutenmusik" para los bailes anuales de la corte celebrados en carnaval por Frederick. La música fue interpretada por 24 oboístas, especialmente seleccionados de varios regimientos del ejército prusiano.

En 1749, Janitsch se casó con Johanna Henriette Eymler, la hija adoptiva del funcionario y alcalde Albrecht Emil Nicolai. Janitsch murió a los 55 años de edad, aunque se desconoce la fecha exacta de su muerte. Algunos años después de la muerte de Janitsch, el compositor Johann Wilhelm Hertel comentó que era un buen contrapuntista y que sus cuartetos son aún ahora los mejores modelos en su género.
El estilo compositivo de Janitsch es típico del galante y el 'empfindsamer Stil' (estilo sensible) de la primera mitad del siglo XVIII. Aunque varias de las obras de Janitsch ya fueron publicadas por Breitkopf durante su vida, la mayor parte de su producción sobreviviente existe en forma de manuscrito. El depósito más grande de las obras sobrevivientes de Janitsch es el archivo de la Sing-Akademie zu Berlin , que se pensaba que había sido destruido durante la Segunda Guerra Mundial hasta que fue redescubierto en el Conservatorio de Kiev en 2000. También hay muchos otros manuscritos en bibliotecas de toda Europa.